单独计税和合并计税是两种不同的企业所得税征收办法。单独计税是指各独立纳税人按照其企业自身的完整经济活动状况分别计算应纳税所得额及缴纳企业所得税的一种纳税方式。而合并计税是指同一纳税年度内的两个或两个以上的法人、其他组织或其他单位，依法在所属税务机关办理纳税申报手续，同时成为合并纳税义务人，按照合并纳税规定计算应纳税所得额的一种纳税方式。那么，在具体操作中又该如何选择呢？下面我们就从资金、税Collector等方面进行对比分析。
1.资金
单独计税的优势在于资金更为独立。因为各自纳税，各自分别缴纳企业所得税，所以相对来讲，各自的可支配资金更多些。
而合并计税则是按照合并的纳税人进行计算，不能区分业务，所以在可支配资金方面相对单独计税较少一些，不过这方面的差别并不显著。
2.税Collector
单独计税的企业所得税税率为25%，合并计税则有三级不同税率，分别为15%、24%和25%。如果所得额大于1500万元，合并计税是不划算的。
同时，单独计税企业固定资产的所得减免政策更加优惠，也能有效降低所得税负担。
3.其他因素
合并计税需要考虑的问题比较多，其中就有关联交易的问题。因为如果存在不合理的关联交易，那么可能就会遭到税务机关的调查，这种调查往往会带来较大的不确定性和财务风险。
此外，也有公司因为合并计税存在固定资产投资和波动问题等而最终选择单独计税。
结论
如果公司规模不大，且不存在转移利润的情况，单独计税往往更优。但如果规模较大，且存在关联交易等问题，那么可能合并计税更为合适。当然，实际操作中需要根据具体情况来做出选择。
